在景程、祁進、王勝奇、於君、邢萬裏、周宇翔、肖恩等中心主任組成的管理團隊的帶領下，中心基本建成了集技術創新、成果轉化、綜合服務、人才培養為壹體的具有國際先進水平的生物芯片研發和產業化基地，形成了年產生物芯片配套儀器300余臺、生物芯片1萬片的規模。數十項成果進入國內外生物醫藥市場，建立了基因、蛋白質、細胞、組織“四位壹體”的系統化生物芯片技術服務平臺，開發了壹系列具有自主知識產權和較強國際競爭力的產品，其中多項為國際首創。該中心培養了3名博士後，22名博士研究生和30名碩士研究生。目前，該中心有22名博士生，8名碩士生，8名工程碩士。
中心致力於基於生物芯片的醫學系統生物學的研究與開發，先後承擔並完成了國家863重大專項“生物芯片的研究與開發”、973”、985”、國家自然科學基金等重大課題和重點項目，在生物芯片的幾個關鍵技術領域取得了壹批具有自主知識產權的原創性技術成果。中心自主研發的60余項生物芯片相關產品和服務，包括各類生物芯片、生命科學儀器、軟件和數據庫、生物材料和試劑、對外技術服務等，已陸續投放市場並出口歐美等20多個國家，為科研、生物安全檢測、藥物研發、臨床診斷等多個應用領域提供了“全新的高通定量技術平臺和整體解決方案”。
2007年9月29日，國家發展改革委在北京召開了生物芯片北京國家工程研究中心(以下簡稱中心)項目竣工驗收會議。驗收委員會由國家發展和改革委員會副主任張任主任，由20名相關領域專家和有關部門負責同誌組成。根據《國家工程研究中心管理辦法》(國家發展改革委令第52號)和原國家計委對北京生物芯片國家工程研究中心可行性研究報告的批復要求，驗收委員會聽取了項目建設總結報告和北京市發展改革委的初步驗收意見，審閱了相關文件並進行實地考察。經過慎重考慮和充分討論，認為該中心驗收資料齊全，建設投資合理。內部管理完善，運營狀況良好，研發、成果轉化和產業化能力處於國內領先、國際先進水平，完成了國家下達的建設目標和任務。該中心已逐步發展成為中國生物芯片產業集技術創新、成果轉化、技術服務與推廣、復合型人才培養於壹體的重要基地，成為推動中國生物芯片產業創新發展的重要力量。驗收委員會壹致同意通過最終驗收，並建議北京市各級相關部委繼續支持北京生物芯片國家工程研究中心的發展。
隨著我國生物芯片產業的快速發展，為充分發揮各行業、各產業、各企業、各團體、各機構標準化工作中生產、管理、科研等方面專家的作用，廣泛開展生物芯片領域的標準化工作，進壹步規範生物芯片行業管理，促進這壹新興產業的有序發展，2008年6月23日，根據國家標準化管理委員會的批復及相關要求，在全國範圍內對生物芯片進行了標準化。國家標準化委員會、國家發展改革委、教育部、科技部、衛生部、質檢總局、清華大學、北京出入境檢驗檢疫局領導及技術委員會全體成員出席了會議。
生物芯片標準化技術委員會經國務院標準化主管部門批準成立，由國務院標準化主管部門領導，國家質量監督檢驗檢疫總局負責業務指導，北京出入境檢驗檢疫局作為承辦單位，生物芯片北京國家工程研究中心作為秘書處負責日常管理。第壹屆全國生物芯片標準化技術委員會由40名委員組成，主任委員為北京生物芯片國家工程研究中心主任，副主任委員為吳永寧、呂祖洪、周、康，委員兼秘書長為北京生物芯片國家工程研究中心常務副主任邢萬裏。全國生物芯片標準化技術委員會的主要任務是根據國家有關政策，提出生物芯片專業標準化的方針、政策和技術措施建議，負責生物芯片國家標準化的技術歸口工作，負責生物芯片基礎、相關產品和檢測方法等領域國家標準的制修訂。將按照全國專業標準化技術委員會的章程和國家標準委的有關規定進行管理。中心以市場為導向，在國內成功探索出壹條“中心+公司”的企業運營模式，具有持續的技術創新能力和成果轉化能力，走上了良性循環的發展之路。