中國高新技術成果轉化受制度、投入、市場等多種因素的影響，使科技成果轉化不暢，造成了科技成果轉化率、轉化效益和對經濟發展貢獻度偏低等局面。
（壹）制度因素
科技成果轉化的制度因素是指對成果轉化起消極作用的制度或政策。主要包括科研立項體制、企業經營機制、職稱評定制度和成果評估及利益分配機制等4個方面。
1.科研立項機制
科研選題立項是科學研究工作中的壹個重要組成部分，它不僅關系著科學研究能否順利進行，而且關系到科學研究成果能否順利轉化。受傳統計劃經濟的影響，項目的立項和科研帶有強烈的行政色彩。科研經費長期以來壹直由國家撥給，科研成果也是由國家組織鑒定，這在壹定程度上“引導”著科研項目從選擇立項、確定研究的深度與方向到項目的評價等，大都是為了獲取相當級別的學術獎項，科技人員不必花費精力去考慮成果的轉化，更沒有必要為完成科技產品的後繼開發而在市場中苦尋商機，致使重研究輕轉化的問題嚴重。這樣，由於缺乏市場對科研成果應用價值的評判，大量的科研成果理論性強，但適用面窄，少有市場需求大、產業價值大的成果，對企業的吸引力降低，企業對科技成果轉化各方面的投入也相應減少，致使大量的成果“賦閑”與有錢找不到好項目的不平衡現象十分突出。
2.企業經營機制
在過去計劃經濟體制下，產品的開發、設計、生產、擴散等，都是由政府控制的，而在社會主義市場經濟體制下，企業成為科技成果推廣、應用的主體，政府則演變為宏觀經濟的調控者。企業功能的轉變由於處於計劃經濟向市場經濟過渡的時期，舊的科研體制阻礙著企業作為科技轉化主體作用的發揮。主要表現在：①企業管理的各個方面還留有計劃經濟的痕跡，現階段企業在戰略管理及決策上還受到政府及上級部門的約束，企業的自主權難以發揮。②企業的經營活動在很大程度還是受到政府的幹預，眾多企業產權關系不明確，使他們缺乏技術創新的動力。③我國的科技主力主要集中於研究院所和高等院校，企業缺乏進行科技成果轉化的高科技人員，無法對科技成果的先進性、適用性、市場前景做出正確的分析。正是由於以上因素的存在，使企業缺乏依靠科技進步實現自身發展的動力，而是憑借現有的資源和工藝維持現狀或依賴生產資料投入量的增加片面追求企業經濟效益的增長。管理的決策者也往往不註重長期投入，致使企業的科技成果研究與轉化具有明顯的短期行為。
3.職稱評定制度
目前高等學校和科研院所的技術職稱評定指標體系壹般都以科研論文（著作）發表數量和質量、科研成果獲獎數量等量化指標為依據，而且是必須達到壹定標準才有資格參與職稱評審，對於是否申請專利、是否產生經濟效益卻不做要求，也沒有把這些指標作為晉升、評獎、計算工作量的條件之壹。這壹制度使得高校和科研院所將科研工作的重點放在科研成果的學術水平和獲獎登記上，促進了科研成果的產出量，但對成果轉化水平和質量則重視不夠，導致科研人員不註重市場信息收集與研究，缺乏對市場需求的認識，花費大部分時間和精力用於研究及其論文的撰寫，而少有精力考慮到科技成果的可行性、實用性、經濟性，研究成果與市場需求明顯脫節，科技成果轉化能力低下。
4.成果評估及利益分配機制
科技成果本質上是對科技開發研究的創造性的活動做出價值判斷的過程。我國雖然於2003年頒布了《科學技術評價辦法》，但該辦法對科學技術評價的基本程序和要求僅做了原則性規定，再加之科技成果本身的成熟程度、市場未來的不可預知性以及缺乏權威的科技成果評價機構等原因，我國的科技成果評價機制尚不完善。評價方式上，重視對結果的評價，忽視對過程的評價，過分強調學術產出和學術水平從而產生了學術上的浮躁心理和急功近利現象。評價過程上，重視轉化前（科技的研究、開發、小試、論證）評價，忽視後期（科技的中試、轉讓、轉化、應用）評價，導致實驗室產品無法順利進入市場（歐陽迪，2010）。評價對象上，多以科技人員為主，忽視了從事科技成果推廣的廣大科研管理人員，使得懂技術、會管理、善經營的專門人才普遍缺乏（李建成，2008）。
利益分配是壹個關系復雜的問題，牽扯到諸多的利害關系。高等學校和科研機構的科技人員由於缺乏市場談判和交易經驗，在不完善的技術交易市場中常常處於劣勢，再加上市場信用、科技評價、法律法規等因素的約束，致使其利益難以得到真正的體現和尊重（李瑋，2006）。盡管國家已經出臺了壹些政策法規，但缺乏配套的實施細則，協調和監督都十分乏力，造成供需雙方在價格和利益分配上有分歧，影響成果轉化的結果。
（二）投入因素
投入因素是指在科技成果轉化過程中，在人力、財力、物力上投入的不充分。科技成果轉化需要投入大量的資金、人才、物質條件等要素資源，並將各種要素資源進行優化配置，才能實現成果轉化。投入機制不健全會影響科技成果的有效轉化。
1.資金投入不足
資金是科技成果從實驗室轉向企業商品化的重要保證和前提。由於成果轉化是壹項高風險、高投入、高收益、周期長的活動，決定了難以從常規的商業渠道中獲得足夠的資金支持。對於高校和科研院所來說，自身並不具備自我轉化的資金實力；對於金融機構來說，處於安全的考慮，大多數願把資金借給壹些有名氣、實力雄厚的大公司；對企業來說，面對承擔高風險的巨大壓力，企業希望通過有關政策與風險投資機構、金融機構***同承擔風險（劉海燕，2002）。沒有資金的支持，成果轉化就無從談起。實行市場經濟體制以來，我國的金融市場有了巨大發展，但尚未形成由國家、地方、企事業單位、金融機構及其他組織或個人***同投資的多渠道、多層次的投融資體系，傾向於科技研發的風險投資依然較少，用於中試、商業化和產業化環節的資金更加有限，不利於科技成果的轉化。
2.高水平人才缺乏
人才是實現科技成果轉化的最關鍵要素。專業化科技推廣人才缺乏是我國科技成果轉化中較為普遍的問題。相關人員缺乏市場工作經驗，既不能對成果進行深層次的評估和咨詢，又不懂得市場營銷技術，對科技成果的轉化多以組織參加各種成果展覽、交易、信息發布會的形式進行，服務工作沒有深度，導致成果推不出去，資金引不進來，具有市場前景的科技成果多數停留在理論和實驗階段，難以成熟和應用，成熟的技術又難以迅速地搶占國內國際市場，經濟和社會效益沒有發揮。
3.技術及設備配置不合理
科技成果轉化的復雜性決定了其需要相關技術和設備的配套，包括科技圖書文獻資源的利用、大型儀器設備條件資源的***享等。目前科技圖書文獻資源和大型儀器設備資源主要集中在高校、科研機構，除了壹些資金雄厚、有實力的大型企業外，壹般中小企業很難承擔技術及設備的費用支出，但是高校、科研機構的科技資源多限於內部使用，外部企業很難***享其資源，這在壹定程度上阻礙了企業的科技成果轉化。
（三）市場因素
市場因素是我國科技成果轉化中的主要障礙。主要包括市場交易平臺欠缺、中介服務機構不健全等方面。
1.市場交易平臺欠缺
市場交易平臺是科技成果轉化的技術保障。近年來，我國科技成果的技術市場從無到有獲得了壹定的發展，科技信息交流會、技術交易會、通信技術網絡、技術開發招標會等是我國主要的技術交易形式。但技術市場發育尚不完善，成熟度比較低，組織不夠健全，缺少區域性、全國性的信息網絡（詹靜濤，林皎，1996），高校科技信息交流多為區域內流通，系統內循環，而與生產部門的供需信息交流還不暢，不能滿足技術交易需要。同時，科技成果轉讓法規不健全，管理不夠規範，對信息的真假、來源鑒定不夠，致使虛假信息介入市場，無法滿足客戶的需求。
2.中介服務機構不夠健全
科技中介服務機構是科技成果轉化過程不可缺少的重要力量，是轉化、擴散科技成果和有效配置科技資源的重要渠道。雖然近幾年在國家的大力推動下，中介機構發展迅速，為科技創新和科技產業化作出了重要貢獻，但是從整體上看，我國科技中介機構的發展仍處於起步階段。中介服務機構大多功能單壹，結構不健全，服務能力較弱，提供信息服務不及時或缺乏準確性，導致科研機構的很多成果找不到需求者而無法實現轉化，企業需要的技術成果也找不到合適的供應者，無法實現對科技成果轉化的有力支撐。中介機構良莠不齊，服務能力差距較大，懂技術、懂經營、熟悉法律的技術人才嚴重匱乏，並且缺少專業的風險評估、技術評價、技術定價的能力，使得企業對於科技成果的價值風險很難做出判斷，市場實現困難（歐陽迪，2010）。因此，在發達國家的科技成果轉化過程日益依靠中介服務體系提供各種服務的情況下，我國中介服務及其機構卻從數量和功能上都遠遠不能滿足科技成果轉化的需要。