“天目山藥業”商標於1987年首次使用，並於1997年在國家商標局正式註冊。批準使用的商品為第五類:片劑、酒、酊劑、丸劑、糖漿劑、滴眼液、紙制劑、顆粒劑、口服液。2006年，公司決定繼續推進公司商標及其他品牌的建設，將“天目山藥業”商標提升為國家馳名商標，並委托杭州現代商標公司將“天目山藥業”商標延伸註冊至1、2、10等7類。10多年來，“天目山藥業”商標所指的商品和服務已基本覆蓋華東六省1城市，成為知名品牌。公司壹直高度重視企業知識產權的保護和企業形象、品牌的宣傳，在總經理辦公室下設商標管理小組，由副總經理任組長，辦公室主任任副組長，負責商標的日常管理、註冊、認定、續展、維權和宣傳，並建立了商標管理的相關制度。在此基礎上，取得了壹些成果。2003年，“天目山藥業”商標被杭州市工商行政管理局認定為著名商標，2004年被認定為浙江省著名商標並延續至今。同年被評為浙江省高新技術企業。2008年9月，被浙江省科技廳授予“浙江省農業企業R&D中心”稱號，並與科技部星火計劃辦公室合作開展國家星火計劃——珍稀瀕危中藥材鐵皮石斛栽培技術優化集成應用項目。近三年來，公司在“天目山藥業”品牌的廣告宣傳和維護上花費了近千萬元，極大地提升了企業形象和產品知名度，擴大了產品的市場份額，提高了企業的經濟效益。