1989年7月5日，北京市市政管理委員會(89)通知市政府辦公廳(89)根據61號文件，北京地鐵公司將更名為北京地鐵總公司。
2001年7月26日，根據市委市政府精神，成立北京地鐵集團有限公司、北京地鐵建設管理有限公司、北京地鐵運營有限公司(以下簡稱地鐵運營公司)。改制後的地鐵集團公司為國有獨資公司，市政府為地鐵集團公司的出資人，以原地鐵總公司及其所屬企業的國有資產作為對地鐵集團公司的出資。地鐵集團公司以獨立法人財產承擔地鐵建設融資。地鐵集團公司以其獨立的法人財產，承擔地鐵建設的融資和還貸責任，實現本市地鐵建設的總體目標。同時以投資的形式成立地鐵建設公司和地鐵運營公司。地鐵建設公司和地鐵運營公司都具有法人資格。
2003年6月5438+065438+10月17日，為適應我市軌道交通快速發展的需要，降低投融資成本，減輕財政負擔，北京市國資委發布《關於北京地鐵集團有限公司管理體制改革有關問題的通知》，將北京地鐵集團有限公司變更為北京市基礎設施投資有限公司(以下簡稱我公司)。地鐵建設公司和地鐵運營公司從原地鐵集團公司中剝離出來，成立北京市軌道交通建設管理有限公司和北京市地鐵運營有限公司。我公司承接了原地鐵集團公司的投融資職能。近期主要以軌道交通投融資和網絡管理為主，承擔基礎設施項目立項、可行性研究、方案設計和網絡研究，負責軌道交通相關資源開發業務的業務研究。