壹是證券賬戶和結算賬戶的設立和管理。投資者在從事證券交易前，必須向證券登記結算公司提交相關開戶材料，開立證券賬戶後方可從事證券交易。投資者通過證券賬戶持有證券，證券賬戶用於記錄投資者持有證券的余額及其變動情況。通常是證券公司等開戶機構代表證券登記結算公司為投資者開立證券賬戶。證券公司直接為投資者開立資金結算賬戶。證券登記結算公司僅為證券公司開立結算賬戶，結算賬戶專用於證券交易完成後的結算交割，具有結算履約擔保功能。
第二，證券的存管和轉讓。在無紙化交易模式下，投資者持有的證券必須集中在證券登記結算系統，證券轉讓行為可以通過電子數據傳輸完成。
第三，證券持有人名冊和權益登記。證券登記結算公司根據與發行人簽訂的協議，向證券發行人提供證券持有人名冊，準確記錄證券持有人的必要信息。
第四，證券交易所上市證券交易的清算、結算及相關管理。證券的清算和結算統稱為證券結算，包括證券結算和資金結算。證券交易所上市證券的清算和交收由登記結算公司集中辦理。主要模式是證券登記結算公司作為中央對手方，與證券公司完成證券和資金的凈額結算。
第五，發行人委托的證券權益分配。登記結算公司可以根據發行人的委托，向證券持有人派發紅股、股息、利息等證券權益。
第六，辦理與上述業務相關的查詢、信息、咨詢、培訓服務。證券登記結算公司按照有關規定為符合條件的單位辦理相關業務查詢。
第七，國務院證券監督管理機構批準的其他業務。例如，為證券持有人提供代理投票服務。