中科院合肥研究所質子治療系統研究團隊在部件研制、集成組裝技術、系統軟件聯調聯試等幾個重要環節取得了開創性進展。目前，世界上最緊湊的納米管旋轉質子重離子系統加速器已經研制成功，因此成功產生了200MeV質子束，並實現了緊湊型納米管網絡加速器的技術水平自主可控。超導磁體的電流強度為140A/mm2，是世界同類機械設備磁場的3倍。電場應用達到國際最高水平175kV/cm。網絡加速器完成了3.0特斯拉汽車的最大磁場強度；
直徑減小25%，只有2.2米，總重量不到50噸。經過幾個月的系統軟件調整，成功完成了診斷室的射束生成，解決了射束傳輸與精確適形治療緊密結合的難題。成功研發設計的國內首臺高純石墨減能器，可調節70-185CeV的動能，匹配範圍為4.1g/cm2-22.7g/cm2，精度為0.5CeV，完成了國內首個外冷雙極鐵超臨界萃取系統軟件的開發設計，完成了小型化納米管旋轉系統軟件的設計方案，大大降低了開發建設成本。
合肥市政府部門聯合成立合肥中科離子公司，開展國產納米管旋轉式質子重離子系統軟件的自主研發，推動質子醫療健康機械設備產業發展。中科院等離子體所運營多項核心技術，推動了大中型科研工程設計的應用和推廣，促進了納米管、磁場、超低溫等醫療衛生機械設備的應用，服務於？身心健康中國？戰略和國內健康產業的發展趨勢，服務於經濟發展和老百姓生活健康的主要位置的項目。