美國雜交水稻專利文獻主要來自德克薩斯州、加州、中國大陸等地區。例如，RingAround產品公司、RiceTec公司、NorCal野生稻公司、KenFoster、BarryL.Tillman、EugenioS.Sarreal等提交了相關專利申請。中國國家種子公司也提交了幾篇申請。
在中國國家知識產權局，除了南京兩優培九種業有限公司，全球還有其他單位、個人公開了200多篇雜交水稻發明技術專利文獻。其中，國外申請較少，主要來自美國、日本。例如，美國圍環物產公司的CN91102598.7號文獻涉及壹種利用多年生雄性不育稻植株生產雜交稻的方法。日本某公司的CN88109218.5號文獻涉及壹種培育雜交水稻種子的方法。它包括使雄性不育性母本水稻具有抗除草劑性，將母本水稻與父本水稻雜交以生成雜交水稻種子，以及通過使用母本對其有抗性的除草劑來處理親本，以便只將父本水稻殺死，從而選出雜交水稻種子。日本兩家公司聯合申請的CN01816569.號文獻涉及壹種針對雜交水稻育種中的Rf-1基因恢復BT型細胞質雄性不育基因的檢測方法。它能利用Rf-1基因座附近存在的數個PCR標記座與Rf-1基因座連鎖的特性，檢測Rf-1基因。
中國當事人提交的雜交水稻專利申請最多。其中，個人申請約56篇，某些自然人擁有的專利技術有廣闊的應用前景，已經通過民營高科技企業獲得市場推廣。研究機構申請約135篇。科研機構申請人主要有廣東省農業科學研究院水稻研究所、湖南省植物保護研究中心、湖南省雜交水稻研究中心、華南農業大學、南京農業大學、江蘇省農業科學院、四川省農業科學院作物研究所等。企業申請較少，其中大北農等公司的專利實力最強。作為南京兩優培九種業有限公司的控股企業，大北農集團是中國最大的農業公司之壹。在全國農業企業中，大北農集團的科研實力最強。從市場布局看，它是唯壹可能與孟山都等國外農業企業集團抗衡的中國本土企業。中國農業的希望依靠大北農這樣的民營科技企業集團。
原位雜交( In Situ Hybridization,ISH)
是用標記的核酸探針，使用非放射檢測系統或放射自顯影系統，在組織切片、細胞塗片及染色體制片上等對核酸進行定性、定位和相對定量研究的壹種分子生物學方法，具有靈敏、特異、直觀等優點。已逐漸成為分子生物學和分子病理學的常見技術之壹，廣泛應用於腫瘤生物學、血液病理學、遺傳、微生物學、細胞和分子生物學、神經內分泌學、免疫學等領域及治療評估和預後判斷等研究中。 菌落原位分子雜交：是指將轉化或感染後的菌落印影在濾膜上，用堿裂解，中和後洗凈烘幹，再用目的基因的放射性DNA或mRNA作探針(Probe)進行雜交放射自顯影，凡出現黑點的菌落即應中選。