神經外科是杭州市重點醫學學科。科室以重型顱腦損傷的救治為中心，以腦血管疾病的搶救為重點，以腦腫瘤的微創治療為特色。集顱腦損傷、腦血管疾病、腫瘤的治療、預防、搶救、科研為壹體，充分發揮學科交叉、資源共享的優勢，成功開展了壹系列神經外科疾病的診治，其中重型顱腦損傷搶救成功率達到國內先進水平，是杭州市交通事故聯合搶救中心的主力科室。
耳鼻喉科:杭州市重點學科。在耳鼻咽喉-頭頸腫瘤外科、耳顯微外科、鼻腔鼻竇微創外科、咽喉和嗓音外科、聽力疾病、過敏性疾病、眩暈疾病的診治等領域。，不斷取得創新成果，填補了多項省市技術空白，綜合實力位居浙江省前列，成為浙江省喉癌患者診療最集中的學科。
腫瘤學是杭州市重點學科。擅長手術、化療、介入治療、生物治療等多種腫瘤的綜合治療。熟悉和掌握國內外腫瘤診療的最新技術和中西醫結合的方法。治療患者有效率達到國內領先水平。主持完成國家自然科學基金面上項目、浙江省科技攻關項目、浙江省自然科學基金項目等數十項重大科研項目，參與完成國家863項目，獲得多項國家發明專利和省市科技進步獎。
醫學檢驗是杭州市重點學科。科室集醫學、科研、教學於壹體，配備了先進齊全的醫學檢驗儀器設備。由放射免疫中心、臨床化學實驗室、臨床微生物實驗室、臨床免疫實驗室、基因擴增實驗室、艾滋病篩查實驗室、門(急)診實驗室等多個專業檢驗室組成。主辦國家級和省級特殊檢驗醫學臨床應用進展繼續醫學教育班。