很難獲得強磁場，特別是高度穩定和均勻的磁場。1)首先這需要低溫技術，液氦的溫度是-269；為了在儀器中保持大量的液氦，通常的方法是在外面加壹個液氮(-196)夾套。2)零件的加工精度需要保證樣品所在區域的磁場強度恒定，因為這關系到分辨率。3)電子系統的穩定性要求很高，需要抑制電壓波動，否則會破壞靈敏度甚至精度。
無論是化學領域的核磁共振譜儀，還是醫學領域的核磁共振成像儀，基本原理都是壹樣的:在磁場的作用下，核能級發生分裂，在射頻脈沖的作用下，能級發生躍遷，從而產生信號。另外，信號探測器需要能夠探測到原子核產生的宏觀磁矩，這種磁矩非常微弱，即使是線圈的熱噪聲也會影響其靈敏度，所以才會有液氮之類冷卻的低溫探頭。
由於上述原因，制造核磁共振儀是壹項復雜的技術。壹般核磁共振譜儀是布魯克和瓦裏安，核磁共振成像儀器主要是西門子、通用電氣和日立。這就導致:1)核磁共振儀很貴。MRI機價格50萬-1，000，000美金，這是MRI機的成本和價格指導。所以折舊貴，分攤到檢測成本也貴。2)核磁共振的維護成本高。核磁振動器需要液氮和液氦來維持超導磁體產生的強磁場。即使停止，也需要消耗液氮和液氦。液氮雖然價格不高(通常每升不到10元)，但消耗速度是每小時0.4升，所以消耗量很大。液氦很貴，壹般每升200元。液氦每3-4個月加壹次，每次費用1，000元。