回國後，主要從事不對稱合成方法學海洋天然產物全合成，高技術研究。先後獲得首屆國家傑出青年科學基金、上海科委啟明星計劃基金、中國科學院“95”重點科研計劃、國家計委95攻關，國家“973”，國家科技部“863”，上海市“十五”重大，國防科工委“十五”重大基金的支持。發現以氯黴氨為手性配體誘導的碳碳不對稱加成反應。並成功應用於抗艾滋病藥物的合成。系統研究海洋吲哚生物堿的不對稱合成及其抗癌生理活性測試。主持“863”項目中創造性地發現純紅光材料和蘭光材料。完成了生物降解聚合物PDLLA的研究並轉化為產業。發表文章90多篇，獲得30多項國內外專利。多項發明技術轉化為工業化生產。成功地將高技術企業中科合臣股份公司上市。培養博士生20多人，8人已獲得學位。培養博士後（企業博士後）20多位。多次應邀國際會議做邀請報告。姜標博士1995年後先後獲得，中科院上海分院先進科技工作者，96年上海市科技系統先進青年科技工作者，上海市第二屆十佳科技啟明星，96年中國優秀青年科技創業獎。96年求是基金“傑出青年學者獎”，97年上海市十大傑出青年，97年上海市優秀博士後，97年中科院自然科學二等獎，97年上海市回國留學人員先進個人，00年中國科協求是傑出青年獎，01年世界華人有機化學會議傑出青年獎，01年上海徐光啟科技獎，02年上海市科技進步壹等獎，03年吳蘊初化學化工科技進步獎，03年中國改革人物優秀獎，03年中科院抗SARS優秀***產黨員，03年上海市抗SARS優秀***產黨員，04年入選國家新世紀百千萬人才工程。姜標是壹位事業心、愛國心很強，富有創造性並取得顯著成績的青年化學家。
2012年10月9日，任上海高等研究院副院長（正局級，任期5年）。