截至2014年4月，學校建有院士工作站1個，省級研究中心1個，市級研究中心2個、校級研究機構15個。
院士工作站：與中科院謝毓元院士團隊聯合建立了河南省四大懷藥院士工作站
省級研究中心：懷藥及天然藥物提取分離河南省高校工程技術研究中心
市級研究中心：焦作市柔性自動化控制工程技術研究中心 、焦作市懷藥工程研究中心
校級研究機構：戲劇文化研究所、產業經濟研究中心、現代輸送機械研究所、先進電器控制技術研究所、陶瓷研究所、新型建築材料研究所、情報信息中心、心理研究咨詢中心、懷川文化研究所、翻譯中心、軟件技術研究所、高等教育研究所、材料與資源研究所、覃懷民間藝術研究所 、化工研究所 2009年6月13日懷藥研究中心的“三位地黃飲”，通過河南省科技廳新產品成果鑒定。
化工研究所的《磷酸二氫鉀生產新工藝》2004年通過省科技廳鑒定，納入國家星火計劃，編入《世界優秀專利技術精選》和《中國科技成果大全》。《硝酸鉀生產新工藝》1992年通過省級鑒定，1993年獲省科技進步三等獎，編入《中國科技成果大全》《中國“八五”科技成果選》和《世界優秀專利技術精選》。
2010年4月-2015年4月，學校土木建築工程學院有18項成果通過省科技廳鑒定，申請到河南省（重點）科技攻關項目4項，獲河南省科技進步獎1項，獲地廳級科技進步獎12項，省教育廳教研成果獎15項，主參編規劃教材26部，發表學術論文132篇，其中EI收錄論文16篇，核心期刊59篇，國家發明專利2項。
截至2015年4月，學校化工與環境工程學院承擔省部級及橫向科研項目20多項，獲河南省科技進步獎2項，通過省科技廳成果鑒定20項，出版教材和學術專著10多部，在核心期刊以上發表論文90多篇，被SCI、EI收錄20余篇，申請和活動國家發明專利60多項。
截至2015年4月，學校經管學院教師申報並獲批省部以上的科研課題20項，***獲得科研經費10萬元；完成地廳級以上的科研課題60余項，其中獲得壹等獎10項，二等獎15項，三等獎12項；發表學術論文500余篇，其中核心期刊論文85篇，被EI、CSSCI收錄的論文16篇；主編教材50余部，參編教材300余部。
據教育部科學技術司官網公布的統計數據顯示，學校2010年科技經費34.8萬元，2011年70.4萬元，2012年78萬元，2013年55.9萬元，2014年12.9萬元。 館藏資源 截至2015年4月，學校圖書館有藏書169.8萬冊，其中紙質圖書137.3萬冊，電子圖書32.5萬種；中外文專業期刊638種；建立起理、工、文學、經濟、藝術等學科門類的文獻信息資源保障體系。館藏圖書以工業技術、經濟、文學、社會科學等學科最為豐富，收藏有壹批包括珍藏版《毛澤東評點二十四史》、《四庫全書》、《大藏經》等在內的珍貴文獻典籍。
圖書館擁有CNKI、維普、方略學科導航等19個大中型專題數據庫，數據容量60T。2010年，焦作大學圖書館加入中國高等教育文獻保障系統（CALIS）和河南省高等教育文獻保障系統（HALIS）實現資源***知、***建、***享。 學術期刊 《焦作大學學報》是河南省教育廳主管、焦作大學主辦的社科版和自然版方面的綜合性學術刊物。該刊為季刊，是中國學術期刊綜合評價數據庫來源期刊、《中國期刊網》入網期刊、《中國學術期刊（光盤版）》全文收錄期刊、“萬方數據——數據化期刊群”入網期刊。該刊主要欄目為：文學·語言研究、思想政治文化研究、文章學研究、經濟管理研究、懷川文化研究、旅遊·經濟研究、法律研究、教育教學研究、理工研究、百家輯覽等。
學報2003年10月在全國高校學報評選中獲單項獎，2006年“懷川文化研究”專欄受到了河南省新聞出版局的通報表揚。2010年在全國高等學校文科學報研究會和全國地方高校學報第二屆欄目評比中，其中具有地域特色的“懷川文化研究”專欄被評為國家級特色欄目。2014年獲全國地方高校學報“優秀期刊”、“優秀主編”稱號。