壹，高校科研經費的管理現狀
(壹)項目科研經費來源的多元化增加了經費管理的難度。
目前，高校支付的縱向科研經費、橫向科研經費和配套科研經費是高校科研項目經費的主要來源。現實中，提供科研經費的部門對經費的使用沒有明確的要求，各種科研項目的使用要求也各不相同，增加了科研經費管理和核算的特殊性和復雜性，從而增加了科研經費管理和監督的難度。
(二)科研財務管理制度需要進壹步完善。
“項目制”是我國高校科研經費的管理模式，由項目負責人對項目立項、經費使用、項目驗收以及項目形成的資產和成果進行全過程管理。由於壹些高校對科研經費的使用和效益重視不夠，忽視了對經費使用的檢查和監督，導致科研經費的隨意使用。分析原因，有的是現行財務管理制度執行不嚴，有的是由於現行財務管理制度不完善或缺乏有效的監督手段，導致科研投入不能發揮正常作用。
(三)財務管理和審計監督的作用沒有得到充分發揮。
雖然部分高校對不同渠道獲得的科研經費采取“統壹領導、集中管理”的模式，但財務部門無法有效控制科研經費使用的合理性和效率，對科研經費籌集和使用的全過程缺乏了解。項目經費的使用由項目負責人決定，部分財務部門將科研經費作為代管經費管理。目前國家沒有專門針對科研管理和監督的審計辦法，審計部門沒有充分發揮事前和過程中的監督職能，無法及時發現支出中的漏洞，只能在結論出來後對科研經費的使用情況進行審計。
(四)成本核算不規範，導致會計信息失真。
在實踐中，由於教學和科研有著千絲萬縷的聯系，事業經費和科研經費的成本相互滲透，從而影響了科研經費全成本核算的實施。比如很難嚴格區分教學科研和儀器、設備、實驗室、公用事業等。，所以很多高校擠業務費。有的還大量使用餐費、提成等與科研項目無關的個人費用占用科研經費，導致高校科研經費使用會計信息失真。
(五)資產管理不規範，造成國有資產流失。
高校科研經費形成的國有資產監督管理不規範，尤其是電子設備、圖書資料等國有資產。題目做完後，部分資產仍留在個人手中。還有科研經費形成的專利技術等無形資產沒有及時入賬。
二、提高科研經費使用效率，認真開展科研經費審計。
(壹)審計科研經費管理制度的健全性
加強科研經費管理，以制度先行。結合學院工作實際，制定壹套科學的、可操作的、有效的科研經費財務管理方法和制度；制定完善的橫向科研經費管理辦法，切實加強橫向科研經費管理；明確科研、財務、項目負責人的職責權限，完善科研經費管理責任制；學院內部控制制度的執行情況和效果如何？規範和完善科研經費管理制度，確保科研工作順利進行。
(二)審核科研預算和資金使用情況。
1.科研預算管理。科研經費預算的有效執行有利於保證科研活動政策的有序開展，有效控制科研經費的支出範圍和標準，有效防止擠占學校資源和科研經費使用管理失控的現象，從而增強財政預算的約束力。特別是在科研項目立項階段，能否根據科研項目的實際成本合理制定項目預算；在科研項目實施階段，能否按照項目預算和國家、學校關於科研項目管理的規定執行，能否保證科研支出的計劃性和合理性。主要檢查科研經費的使用是否按照批準的預算支出，有無違規支出。
2.科研經費的使用管理。審核費用是否按要求列支，是否存在預算外支出；是否存在國家和學校明令禁止的消費項目支出，項目管理費、人員費用、業務費支出是否合理；科研項目的成本核算能否在經費、人員、設備等方面劃清科研與教學的界限，科研項目的成本能否科學合理；審查對科研項目負責人使用科研經費的監督是否有效，是否存在以協助科研為名挪作他用，是否轉移到有直接經濟利益的掛靠單位，資金轉移業務是否按資金轉移批復、項目合同和有效財務憑證辦理轉移手續，賬目是否清晰， 確保科研經費的安全和合理使用，防止騙取、截留、擠占和挪用科研經費的現象發生。
(三)審計研究經費使用的有效性
效益審計是科研經費審計的重要組成部分。近年來，壹些高校不重視科研項目的管理，對其有效性監管不夠，使得項目效益低下，甚至無效，造成損失和浪費。因此，為了提高科研經費的使用效率，必須加強效益審計，檢查和評價學校科研經費的使用和經濟活動的效率，確定其經濟性、效率性和有效性。項目是否經過充分論證和科學評估，項目管理是否嚴格，是否存在因管理不善造成資金浪費的情況；科研項目是否及時辦理結題和結案手續，是否達到預期目標，社會效益和經濟效益如何。
(4)審計固定資產和無形資產的管理。
審核科研項目活動中購置的固定資產是否納入學校資產統壹管理，並由負責人負責；科研項目結束後儀器設備是否及時回收，由學校統壹管理和調配；為防止國有資產流失，促進國有資產保值增值，是否對科研經費的使用進行跟蹤管理；財務部門是否及時將無形資產納入學校統壹核算。
參考資料:
[1]，張。淺談高校科研經費的管理審計[J].會計通信綜合(壹)2009，(1)。
[2]沈煜，童仁成。美國國家科學基金會的審計監督制度對中國的啟示[J].科研管理，2009，(7)。