典禮由金德水主持。周海夢、陳德榮分別致辭，顧秉林、趙洪祝先後講話。趙洪祝、呂祖善、顧秉林、胡和平***同為大樓落成剪彩。隨後進行了清華大學、浙江清華長三角研究院與浙江信匯合成新材料有限公司等單位15個合作項目簽約儀式，合同總金額12.8億元、總投資54.1億元。
2003年12月31日，浙江省人民政府與清華大學***同組建了浙江清華長三角研究院。研究院以清華大學的技術、人才為依托，充分發揮和利用省校雙方優勢，面向國際競爭，面向浙江與長三角經濟社會發展需求，在先進的制造、信息技術、生物醫藥、生態環境保護、海洋資源開發等領域，設立重點實驗室、工程研究中心和博士後工作站，建立國際技術轉移中心和繼續教育基地，爭取成為國內壹流的科技創新、人才培養和高新技術產業化基地。研究院總部位於嘉興市南湖新區內的嘉興科技城，並在嘉善、平湖設兩個院區。研究院總部大樓高99米，地上21層、地下3層，建築面積5.5萬平方米。
從2003年建立到2008年，在省校各級領導及各有關地方、部門關心支持下，研究院取得了快速發展。如今研究院有員工159人(含下屬公司)，組織了壹支有相當實力的創新團隊。研究院至今已與清華大學、省內外民營企業及地方政府在先進制造、生物醫藥、生態環境保護、信息技術等領域，聯合組建了4個研究所和12個技術研發中心和技術中介機構;累計承擔了80項縱向科研項目，其中包括15項國家級科研項目和36項省級科研項目;與企業開展橫向科技合作項目68項，項目總投資達8億多元;累計發表各類學術文章95篇，申請專利23項，獲得教育部自然科學壹等獎等5項各類科技獎勵。研究院當前已取得智能化植物無糖組培種苗生產裝置、耐熱超氧化物歧化酶、在線水質分析儀、色度儀、微型半導體泵浦綠光激光器、光學芯片PDA軟件等34項研究成果。當前研究院在浙江省內外重點轉化和推廣的本院及清華大學科技成果***計40多項，已經推廣成功、取得較好經濟社會效益的有大型公***建築節能檢測技術、無糖組培技術、牡丹花反季節催花、汙水處理、微囊藻毒素免疫檢測技術等20項。研究院依托清華大學教育資源，從地方經濟社會發展需要出發，至今***舉辦現代經營管理、公***管理等各類培訓班84期，***計結業人數7360人。研究院還努力發揮橋梁紐帶作用，累計促成清華大學與浙江省的科技合作項目21項，項目總投資達56億元。研究院至今已在嘉興引進、孵化了35家科技型企業，累計註冊資本近5億元。
趙洪祝在講話中充分肯定研究院建院以來在科技創新、人才培養和高新技術產業化方面所取得的成績，並代表浙江省委、省政府向研究院表示祝賀。他希望研究院繼續圍繞浙江省以及長三角地區的發展需求，不斷地創新機制，加強各方面建設，發揮好省校合作的橋梁紐帶作用，努力將研究院辦成人才和信息等創新要素的集聚平臺，科研開發和成果轉化的技術平臺，區域經濟技術提升的服務平臺，為浙江省實施創新強省、創業富民戰略作出新的貢獻。浙江省各有關部門要壹如既往地關心和支持研究院的發展，提供必要的服務和幫助;嘉興市委、市政府要把支持和扶持研究院的建設和發展作為壹件大事來抓，加強聯系，關心和幫助解決研究院建設和發展過程中遇到的困難和問題。
顧秉林在講話中表示，研究院的建立是省校合作的重大突破和發展。在浙江省各級黨委、政府的關心支持下，研究院取得較快發展，作出了顯著成績，他代表清華大學對省、市各級黨委、政府表示衷心感謝。當前，面臨國內外宏觀發展環境發生深刻變化的新形勢，全國上下正在深入貫徹落實科學發展觀，這對研究院來說既是機遇也是挑戰。他希望研究院牢牢把握機遇、積極應對挑戰，依托清華，緊緊圍繞浙江經濟、社會和科技發展需求，進壹步做好人才引進工作，充實和加強創新隊伍的建設;進壹步加強科技創新平臺建設，提高自主創新能力與水平;進壹步加強應用型技術的研究，著力解決地方經濟社會發展中的技術難題;進壹步做好地方急需各類人才的培訓工作，為浙江培養更多創新型人才;進壹步發揮橋梁紐帶作用，促進省校合作***贏。清華大學各院、系，各有關部門和單位，都要全力關心和支持研究院的發展，為研究院提供強有力的人才、信息、技術和成果的支撐，利用學校各方面的資源為研究院發展服務。
研究院已經完成了4年初創期的目標和任務，如今，總部大樓的落成和入住，標誌著研究院將進入快速發展階段，從此揭開了研究院建設發展史上新的壹頁。